2002年，合作市被列为国家扶贫开发工作重点县市，围绕扶贫重点乡、重点村和贫困户，该市不断加快交通、通讯、电力等基础设施的建设步伐和生态环境综合治理力度，大面积实施草场改良、人工种草、禁牧休牧、水土流失治理等，是全市农牧业抵御自然灾害的能力明显增强，经济和社会食用稳步发展，贫困村面貌得到综合改善，群众生活水平不断提高。2007年，农牧业增加值达到8172万元，比1998年增加770元，年均增加86元。
       近年来，合作市始终把扶贫开发摆在各项工作的突出位置，紧紧围绕解决群众增收这个主题，突出抓好整村推进、安居温饱、产业开发、易地搬迁、劳务输出为重点的扶贫开发“一体两翼”战略工程，扶贫开发工作取得了显著成效。截至2007年，全市0.8万绝对贫困人口基本解决了温饱，0.83万低收入人口稳定解决了温饱。
       加大建设设施建设力度，农牧村基本条件得到明显改善。10年来，共架设整修农电线路41KM，解决了6乡38个村的生活用电问题，同时为地处偏远、架设线路难度较大的卡加道乡土方村购置太阳能光伏电源57台，暂时解决了群众照明问题；修建人畜饮水工程28处，解决了六乡31个自然村4548人、30458头（只）牲畜饮水困难；修建防洪堤坝2200米，水渠1800米，增加水浇地面积200亩，同时种植优质牧草4964亩，提高草地第一性生产能力15%以上，增加载畜量6.6个羊单位；为255户特困户改造危房；为2个自然村53户接通了有线电视。
      大力实施“农牧互补”战略，农牧业产业化建设初见成效。以牛羊育肥、奶牛、草产业三大基地建设推进产业化扶贫步伐。以市场为导向，依托畜产品龙头企业，大力发展名特优畜产品，促进农业化结构的逐步优化升级，变“原料需产业”为“加工畜牧业”，逐步实现种、养、加、产、供、销一体化的产业化经营。以资源优势为依托，大力发展暖棚科学化养畜。十年来，以利用“两州一地”扶贫资金为贫困户购买奶牛为起点，以企业加工乳制品和城市鲜奶需求为链条，不断加大扶持力度，2000年初，市政府又自筹资金200万元贴息扶持群众，外购奶牛，截至2007年，共投放奶牛4838头，在城效建立奶牛基地，基地每年向社会提供鲜奶120万公斤，户均增加纯收入400元；修建养畜暖棚895座，初步建立了牛羊育肥基地，年出栏育肥牛羊3万多只（头），在全市范围内新建日光温室96座，年产各类蔬菜10万公斤，是高原反季节初参基地初步规模。
      加大科技扶贫力度，劳务输转闯出新路子。多年来，合作市不断加大农牧业实用技术推广，一方面，加强农牧业使用技术培训，使农牧民掌握1至2门实用技术，同时加强畜种改良；另一方面，通过试验示范村推广青稞、油菜和马铃薯新品种，加强农牧民科技培训，累计举办农牧业科技培训班201期，培训农牧民4.2万人（次），培训农牧民技术骨干573人。十年来，共培训电脑、保安、建筑业、农机修理、旅游、餐饮及宾馆服务、烹饪、民族缝纫与编制、电气焊等各类实用技术人员2000多人，年均劳务输出人数达3000人，人均创收2000元，共创劳务经济收入达6000万元。
       发动全社会力量，形成社会帮扶合力。按照“四到五定”的帮扶原则，进一步强化措施，层层落实责任，与市直各部门、单位及六乡四街道签订了社会帮扶工作责任书，坚持领导联系点制度和“2213”帮扶制度，国家、省、州、市四级帮扶单位以“真扶贫、扶真贫”的精神，从所帮扶贫困村和学校的实际出发，想方设法从资金、物质、技术、信息等方面进行帮扶。同时积极动员全社会力量参与扶贫、智力扶贫、文化扶贫和卫生扶贫，形成全社会扶贫济困氛围。建市以来，对全市六乡四个街道的对口帮扶村、学校累计帮扶资金和物质折合人民币466万元，改善了教学条件，有效解决了贫困村、贫困户的实际困难，促进了农牧村经济建设和社会发展。